При Коломенской духовной семинарии совершается профильная подготовка по следующим направлениям: Курсы повышения квалификации для духовенства Московской епархии,
Курсы для монашествующих, Миссионерско-катехизаторские курсы и Библейско-богословские курсы для мирян.